澳洲海关的入境检查比较严格，因为澳大利亚是一个疾疫病害保护区，它是一个海岛，能够和世界上某些最危险的疾疫病害隔离，这些疾疫病害不但危及珍奇的野生动植物，同时也会危及家畜，农作物，树木和其它植物等。澳大利亚是只有少数几个国家未曾受到下列数种致命疾疫病害的侵袭的国家之一，比如口蹄疫，危害家禽和野生鸟类的纽卡索病，以及狂犬病。澳大利亚是世界上唯一没有狂犬病的大陆。澳洲检疫是必须的，以防止可以影响植物、动物、人类健康和环境的外来有害动物及疾病。这角色是由AQIS-澳洲检疫及检查服务(Australian Quarantine and Inspection Service)担任。
当飞机即将在澳洲降落前，空中小姐会发给所有乘客一张澳洲入境卡，不懂英文的乘客会得到一张中文译文的澳洲入境卡，但是必须用英文填写。内容包括个人信息，大概在澳洲停留的时间，和是否有申报等。这张入境旅客卡，是一份法定文件，如果您携有任何食物或植物或动物来源的货物-包括本小册子所列的任何物品，您必须在“是”(YES)栏打钩。如果您携有不想申报的检疫物品，在您前往领取行李的途中及将申报卡交给海关人员前，把物品丢弃于特别检疫标志箱内。最后，入境卡上的签名一定要同您护照上的签名一致。
首先，如果有在飞机上没有吃完的食物，比如饼干，水果，糖果等，都要在领取行李前扔到指定的垃圾桶里。
您抵达澳洲时，在行李输送带可能会遇到检疫猎犬。不用惊慌，它们只是在嗅乘客的行李，寻找检疫关注的物品。如果您看见一只狗在您附近工作，请把您的行李袋放在地上准备接受检查。有时侦察犬会察觉特别的味道，尤其是您在袋内一或两天前放过肉类或水果。检疫工作人员大概会要求检查您的袋子以确保袋内没有属检疫关注的物品，但如果您解释情况，您不会有任何问题。
当然最后要核实自己的行李，以免拿错。如果行李有损坏或未拿到，请直接联络机场行李柜台。?
就是由移民局的官员检查护照，签证和入境登记卡，并询问一些简单的问题，如“来澳洲的目的?”，“计划停留多久?”等等。如果您不懂或略懂英文但无法准确表达自己的意思，入境检查一般会安排免费的翻译服务。最好不要猜谜似的回答问题，以免造成意外的误会。当检查人员在您的护照上盖上入境章时，就表示一切无误，核准入境。
必须申报所有枪支、武器和弹药，包括真枪和枪炮复制品以及通过压缩空气发射弹丸但通常作为“玩具”枪购买的BB弹气枪。其它武器，例如漆弹枪、吹管、所有刀具、双节棍、弹弓、弩、电击设备和拳击指环等也必须申报。一些物品可能需要许可证、警方授权书和安检证才能进口。
带入或带出澳大利亚的货币金额没有限制。但是，如果是10000澳元或以上的澳币以及等值的外国货币，您必须申报。海关要求，如果您携带本票、旅行支票、个人支票、汇票或邮政汇票，还必须填写可转让证券表格BearerNegotiableInstruments,简称BNI)。
不能带入澳洲的东西：有些东西，由于对澳洲的动物及植物的生存有疾病威胁，所以是不准带入澳洲，这些包括有：乳类、蛋及含蛋的产品-包括全个，粉末的蛋及一些有蛋的成份的产品(随同婴儿的婴儿配方，及纽西兰的乳类产品是准许的)。
活的动物-包括雀、鸟、鱼、爬行动物及昆虫。肉类及肉类产品-包括所有非罐装或新鲜、乾、冷藏、烟熏或咸肉。种子及果仁-包括生、没烤过的果仁、生花生、栗子及爆壳。新鲜水果及蔬菜-包括所有新鲜和冷藏的水果及蔬菜。
活的植物-包括插枝、根、球茎、谷物、根茎及茎部。含有或种子制成的手工艺品及纪念品鲑及鳟鱼产品-询问有关特别的入口情况(罐头的鲑鱼是准许的)。
生物材料-包括人类/动物疫苗及治疗货物(询问有关特别的入口情况)。鹿角/鹿茸，食用燕窝包装产品-来自纽西兰的鹿茸或鹿角是准许的(附证明书)泥土及沙-包括填满泥土或沙的物品(不带泥土和沙的石块是准许的)所有猪肉产品。
下列物品在检疫条件许可并事先获得澳洲检疫当局的证明情况下可以另行带入，但许可证必须在你进行海外旅行之前取得;这些物品有：
猫、狗及其他小动物培养液、微生物、动物精子及卵子活的植物，插枝及球茎动物或植物制作的陈列纪念品及珍品婴儿食物(每名婴儿准带一公斤)小量圣水检疫官员会检查这些物品，如果不会带有动植物疾病或害虫的话，再把这些物品还给您。汽车也可以带进来，但在下货后须经严格检查及清洗。
您需要向海关申报所有药品，包括处方药、替代药、草药和中药、维他命和矿物配方。
如果年满18岁，可将2.25升的酒类商品免税带入澳大利亚。随身行李中的所有酒类均属此类，无论购买的地点或方式如何。
超过免税限额的烟(限额50支香烟或50克的雪茄烟或烟草制品/人)